草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿模式最易见的重大疾病其一。肾组织开展中CaOx晶状体过供大于求岩浆岩会促使肾小管神经元拉伤和凋亡，若想促使肾结石的变成。短链人体肌肉酸由肠内内生物滤池细菌和病毒酵伙食仟维诞生，仅仅在线条肠内第一道防线中挥发帮助，但是在模式水平方向上也挥发重要性帮助。表中，丁酸是最充足的短链人体肌肉酸，具备消除炎症和免疫检测阻止帮助,本探究论述丁酸对CaOx肾结石的帮助还有意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山专科医院泌尿整形科吴忠教援、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健医生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了系统临床药理学服务管理，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容标题：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 朋友计量单位：华山宠物医院 论述物体：大鼠、HK-2血细胞 分成小组短信：剖析组（Con）、沙盘模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱给出新技术：线上临床药理学检测工具

难点注意事项图

研究探讨成果

科学钻研员工第一步融合大鼠建模方法，按照生理学什么是生化招生指标和组织机构病检学固色等科学钻研途径知道丁酸行缩减CaOx建模方法大鼠肾CaOx单晶体的演变成和磨损，调理CaOx建模方法大鼠的感染磨损和硫化反应有机化合物的过分呈现。不仅，丁酸还可治理和改善草酸诱惑的HK-2组织磨损、硫化反应应激状态和组织凋亡。 为来探寻丁酸构成和靶dna组网，设计人从PubChem了解丁酸和丁酸酯的二维和3d构成（图1A）。可以通过PharmMapper数剧库和Uniprot数剧库治理 后共挑选出113个丁酸靶dna组供进一歩定性剖析。将dna组下拉列表带到STRING数剧库，进行PPI网定性剖析。Cytoscape得出了顺序排列的前20的核心区靶dna组的详实网图，涉及到CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这种核心区dna组与网中的其它的dna组均表現出千万的想关性，情况说明这种dna组或许充分更好地发挥着信息化的角色。GO和KEGG定性剖析论述了丁酸核心区dna组的想关方法和海洋生命科学技能（图1C）。核心区dna组具体与类固醇皮质激素类初次初次应答、阳极阳极氧化应激状态状态初次初次应答、检查是否活化氧人体细胞对类固醇皮质激素类热血的反映及其对酸碱性检查是否有机物的反映密切相关。上面根据上述，这种核心区dna组具体操作了阳极阳极氧化应激状态状态和对检查是否活化氧的海洋生态学反映的过程，是肾结石形成了制度化中至关极为非常重要的方法，这表述丁酸或许在肾结石中充分更好地发挥极为非常重要的角色。

图1| 丁酸结构特征与靶基因遗传网络信息解析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进那步科学实验实验丁酸对CaOx肾结石更何况切靶染色体组，科学实验实验成员利用率GEO数据源实验库对GSE73680中绿色健康参考与CaOx肾结石病朋友的染色体组不同实施了科学实验实验。参考组与CaOx结石病朋友的重要性不同抒发染色体组（DEGs）染色体组组检测标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个染色体组造成重要变化规律，各举3379个（89.4%）染色体组抒发调涨，404个（10.6%）染色体组抒发降低（图2A）。对DEGs实施聚类算法实验法实验，热图表明了前10个被选中DEGs的二维层次聚类算法实验法特性（图2B）。接下来，科学实验实验成员依据GeneCards数据源实验库人工成本司法鉴定了370个将与CaOx肾结石重要性的染色体组，排名第一前20位的预侧染色体组还有重要性性评价就像文中2C一样。要为选择丁酸开展CaOx肾结石的至关重要靶点，科学实验实验成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性染色体组补救实现了个Venn图。进而，CYP2C9被确实为丁酸影晌CaOx肾结石的不确定性靶点(图2D)。再者，科学实验实验成员还实施了丁酸与CYP2C9的原子项目对接，CYP2C9的五个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在采用网络上药理学学予测CYP2C9是丁酸影向CaOx肾结石的靶dna后，科学研究技术人员还能够 癌细胞核工作表明了CYP2C9可调低草酸诱导性的HK-2癌细胞核的ROS品质、炎症病变伤到和凋亡。

图2| 大多据库联合技术了解估计CYP2C9是丁酸功能于CaOx肾结石的靶基因遗传

实验导致

本研究分析第一体现了丁酸在休外和人体均能控制CaOx肾结石三维模型的空气阳极氧化应激性状态和疾病受损，马上又经过手机微信网络药学学学需求的丁酸影响力CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，最终经过体受损细胞实验报告可确认CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2体受损细胞ROS标准、疾病受损和凋亡。这样的体现了体现了丁酸也许经过控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的空气阳极氧化应激性状态，缓解疾病受损。这类工作中拜谱生物体学能提供了手机微信网络药学学学科技服務，除此以外拜谱生物体学可提供旺盛期健全完善的dna组学、蛋白酶质组学、新陈代谢组学等几组学产品设备及科技服務，欢迎辞致電质询！ 符合文献：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.